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應(yīng)用案例

經(jīng)過20多年的發(fā)展,寶德持續(xù)而深刻地把握市場需求,積累了海量的客戶資源和豐富的服務(wù)經(jīng)驗(yàn)

寶德助地壇醫(yī)院抗擊埃博拉
案例背景

日前,寶德在首都醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院北京地壇醫(yī)院(簡稱“地壇醫(yī)院”)埃博拉出血熱病例應(yīng)急設(shè)備采購項(xiàng)目中一舉中標(biāo),為客戶量身定做的包括硬件建設(shè)、系統(tǒng)建設(shè)、軟件建設(shè)與技術(shù)服務(wù)在內(nèi)的HPC集群解決方案,為地壇醫(yī)院在埃博拉病毒檢測以及后期病原檢測方面的研究提供了高計(jì)算能力、高性能、高存儲的計(jì)算平臺,加快了地壇醫(yī)院提升埃博拉病毒檢測、病原檢測等生命科學(xué)科研水平的步伐。

案例分析

地壇醫(yī)院始建于1946年,是北京市衛(wèi)生局直屬三級甲等醫(yī)院,也是北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部、北京中醫(yī)藥大學(xué)教學(xué)醫(yī)院。國家肝病、艾滋病臨床藥物驗(yàn)證基地、國家中醫(yī)藥管理局中西醫(yī)結(jié)合傳染病臨床基地均設(shè)于此。醫(yī)院主要承擔(dān)除結(jié)核病以外的39種法定傳染病的診治、研究和培訓(xùn)任務(wù),是一家集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防為一體的公共衛(wèi)生臨床醫(yī)療機(jī)構(gòu)。2014年8月埃博拉病毒肆虐非洲,疫情瞬息萬變。地壇醫(yī)院第一批援幾內(nèi)亞醫(yī)療隊(duì)于8 月12日兩小時(shí)內(nèi)集結(jié)完畢趕赴西非。針對可能發(fā)生的埃博拉出血熱疫情傳入風(fēng)險(xiǎn),北京市衛(wèi)生計(jì)生委指定地壇醫(yī)院為埃博拉出血熱定點(diǎn)收治醫(yī)院。中國雖然沒有發(fā)現(xiàn)埃博拉病毒患者,但是疑似患者入院治療的情況還是屢有發(fā)生。為防止埃博拉病毒入侵我國,地壇醫(yī)院啟動了埃博拉出血熱病例應(yīng)急設(shè)備的采購。通過對客戶背景與應(yīng)用需求的深入分析,結(jié)合以往在生物信息與生命科學(xué)領(lǐng)域HPC方面的成功案例,寶德最終為客戶確定了基于寶德生物一體機(jī)PowerScale8000-B高性能計(jì)算機(jī)集群系統(tǒng)的解決方案。寶德PowerScale8000-B是一套應(yīng)用于生物信息計(jì)算的一體機(jī),能為客戶在序列比對、序列拼接、GPU 加速方面提供更的高性能保證;它使用目前業(yè)界先進(jìn)的軟件定義存儲,在安全、性能、管理方面能發(fā)揮極致性能。

解決方案

寶德PowerScale8000-B高性能計(jì)算機(jī)集群系統(tǒng)
寶德PowerScale8000-B高性能計(jì)算機(jī)集群系統(tǒng)作為埃博拉病毒檢測以及地壇醫(yī)院后期病原檢測的主要計(jì)算單元,配合高通量測序儀一起完成地壇醫(yī)院埃博拉病毒應(yīng)急設(shè)備項(xiàng)目,每次要滿足測序儀>150億(15G)堿基數(shù)據(jù)的計(jì)算,并且每次對>2000 萬個(gè)片段序列的數(shù)據(jù)的分析,要滿足98%以上的原始數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。為此,寶德為客戶設(shè)計(jì)了一套擁有10.49萬億次計(jì)算能力的HPC集群整體解決方案。該方案網(wǎng)絡(luò)部分采用雙網(wǎng)分離結(jié)構(gòu),包括管理網(wǎng)和計(jì)算網(wǎng)兩部分,管理網(wǎng)使用一臺千兆交換機(jī)實(shí)現(xiàn)對所有節(jié)點(diǎn)的正常管理;計(jì)算網(wǎng)使用超低延遲核心萬兆以太網(wǎng)交換機(jī)作為數(shù)據(jù)傳輸通路,保證數(shù)據(jù)的無阻塞、高效快速轉(zhuǎn)發(fā),以便更快地計(jì)算出數(shù)據(jù)結(jié)果。存儲部分設(shè)計(jì)了一套分布式的海量存儲系統(tǒng),整套系統(tǒng)可提供70TB的可使用空間、800MByete/s的實(shí)際使用帶寬,以及60萬/s的IOPS 并發(fā)訪問數(shù),以保證數(shù)據(jù)調(diào)用的暢通無阻。事實(shí)上,此次與地壇醫(yī)院的合作只是寶德HPC解決方案在生命科學(xué)行業(yè)成功應(yīng)用的一個(gè)縮影,此前,寶德與華大基因、中國科學(xué)院北京生命科學(xué)院、中國疾病監(jiān)控中心、嘉寶仁和醫(yī)療有限公司等行業(yè)客戶在生命科學(xué)研究領(lǐng)域展開了全面合作,在該領(lǐng)域積累了大量的客戶與行業(yè)經(jīng)驗(yàn)。其中,與華大基因的多次合作更是締造了寶德高性能服務(wù)器PowerScale繪制全球第一張“黃種人基因圖譜”、寶德Power Cluster8000HPC計(jì)算機(jī)系統(tǒng)繪制大熊貓基因兩座里程碑。

客戶收益

波士頓咨詢公司(BCG)發(fā)布的報(bào)告顯示,中國醫(yī)療科技市場將在2013 年至2020 期間保持14%的年均增長率,到2020 年,市場規(guī)模將增至550億美元,成為全球第二大醫(yī)療科技市場。報(bào)告預(yù)測,到2020年,中國醫(yī)療科技市場將超越日本和德國,從2013 年的世界第四位躍升至第二位,占據(jù)全球市場份額的13%。目前,國內(nèi)醫(yī)療科研市場HPC應(yīng)用正處于起步階段,許多國產(chǎn)服務(wù)器廠商在醫(yī)療科研市場表現(xiàn)乏力,醫(yī)療科研市場存在大范圍空白。長期以來,寶德一直致力于國內(nèi)HPC的應(yīng)用與普及,憑借在HPC領(lǐng)域的深入研究,寶德大力開拓醫(yī)療科研市場,在該領(lǐng)域積累了深厚的經(jīng)驗(yàn),填補(bǔ)了醫(yī)療科研市場HPC應(yīng)用的空白,并為加快我國醫(yī)療科研領(lǐng)域的研究成果落地轉(zhuǎn)化做出了突出的貢獻(xiàn)


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