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解決方案

以客戶為中心,提供定制化或一站式的全棧解決方案,賦能千行百業(yè)

寶德高性能計(jì)算之生命科學(xué)解決方案
項(xiàng)目背景

多場(chǎng)景應(yīng)用多需求:生物信息學(xué)(序列搜尋比對(duì)分析)--需要較大的內(nèi)存容量和內(nèi)存帶寬, 需要直連架構(gòu)CPU;分子動(dòng)力學(xué)--對(duì)網(wǎng)絡(luò)需求比較大,節(jié)點(diǎn)間需要使用低延時(shí),高帶寬的Infiniband高速網(wǎng);分子對(duì)接(藥物設(shè)計(jì))--計(jì)算量非常大,消耗計(jì)算機(jī)時(shí)很多;測(cè)序儀離線處理--內(nèi)存、存儲(chǔ)容量需求大,作業(yè)運(yùn)行需要與作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)結(jié)合;電子顯微鏡圖象處理--軟件內(nèi)存需求和IO需求較大,計(jì)算時(shí)間長(zhǎng),系統(tǒng)穩(wěn)定性、可靠性要求高;質(zhì)譜儀原始資料處理--系統(tǒng)計(jì)算量大,計(jì)算時(shí)間長(zhǎng),系統(tǒng)穩(wěn)定性,可靠性要求高。

方案介紹

基于寶德PowerScale 8000高性能計(jì)算集群是一個(gè)有機(jī)的、高性能、高可靠性的集群系統(tǒng)。系統(tǒng)的硬件都選用經(jīng)過嚴(yán)格測(cè)試的主流產(chǎn)品,保證系統(tǒng)的可靠性;互聯(lián)系統(tǒng)各組件的網(wǎng)絡(luò)都是專用的高效網(wǎng),通過集群核心的管理系統(tǒng)使得整個(gè)系統(tǒng)協(xié)調(diào)一致的運(yùn)行,如單獨(dú)的一臺(tái)高性能計(jì)算機(jī)一樣為用戶提供統(tǒng)一的服務(wù)。PowerScale 8000向用戶提供一個(gè)單一計(jì)算機(jī)的界面。前置計(jì)算機(jī)負(fù)責(zé)與用戶交互,并在接受用戶提交的計(jì)算任務(wù)后通過調(diào)度器程序?qū)⑷蝿?wù)分配給各個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)執(zhí)行;運(yùn)行結(jié)束后通過前置計(jì)算機(jī)將結(jié)果返回給用戶。程序運(yùn)行過程中的進(jìn)程間通信通過專用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行。

方案解析

PowerScale 8000系統(tǒng)共配置10 個(gè)雙路八核刀片服務(wù)器。刀片式集群系統(tǒng)在計(jì)算密度、功耗散熱、運(yùn)營(yíng)成本、維護(hù)成本、可靠性等方面,都明顯優(yōu)于其它系統(tǒng),且為系統(tǒng)的擴(kuò)容升級(jí)提供了良好的基礎(chǔ)。計(jì)算系統(tǒng)的選擇實(shí)現(xiàn)了多樣化,分別配置了最通用的雙路八核的刀片節(jié)點(diǎn),這樣的配置可以更好滿足不同應(yīng)用的需求。配置高性能的光纖 SAN 存儲(chǔ)系統(tǒng),配置 20TB 磁盤陣列存儲(chǔ),配置并行文件系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)了多分區(qū)的統(tǒng)一管理和多通道的并發(fā)讀寫。管理網(wǎng)絡(luò)采用千兆網(wǎng)絡(luò),計(jì)算網(wǎng)絡(luò)采用Infiniband高速網(wǎng)絡(luò)互連;主要產(chǎn)品都采用了冗余設(shè)計(jì)(電源、風(fēng)扇等),存儲(chǔ)系統(tǒng)采用雙鏈路冗余設(shè)計(jì),系統(tǒng)的可靠性有較高保證;對(duì)于與測(cè)序儀鏈接的服務(wù)器和存儲(chǔ)設(shè)備,配置了雙機(jī)熱備,保證了系統(tǒng)的可靠性。寶德公司將為用戶提供完善的服務(wù),包括安裝調(diào)試、系統(tǒng)優(yōu)化、用戶培訓(xùn)等,這些都不單獨(dú)收費(fèi),用戶不必考慮這些方面的費(fèi)用。

方案優(yōu)勢(shì)
  • 系統(tǒng)

    系統(tǒng)協(xié)調(diào)高效

  • 高性價(jià)比

    高性價(jià)比且方便后期擴(kuò)容升級(jí)

  • 高可靠性

    高可靠性和完善的服務(wù)

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